猫病毒性肠炎对外界抵抗力强，传染性强。一旦生病，应迅速隔离病猫，严格消毒病猫污染的饲料、用品和运输工具。消毒剂可采用氢氧化钠、漂白粉、过氧化氢等3%。机器消毒可采用紫外线照射。
疫苗免疫是预防猫病毒性肠炎的基本措施。但也不能排除免疫失败，这与疫苗质量和免疫影响有关。主要是由于疫苗毒株选择不当和母源抗体的影响。疫苗应选择质量可靠的进口疫苗。第一次免疫时间一般认为在45岁左右。考虑到10岁前也是幼猫的易感期，提前接种疫苗，60岁时接种6种疫苗，然后每2周接种6种疫苗，持续3次，然后每年免疫一次。
临床上发现猫狗排出暗灰白粥样排便。如果能排除食物因素，首先要怀疑病毒性传染病。广谱抗病毒药物和消炎药应及时充分使用。广谱抗病毒药物的早期应用可以显著缩短疗程，提高临床治愈率。
猫狗病毒性肠炎发生时，消化道出血发生迅速，部分病历在发病后第二天出现烂番茄腥味排便。因此，止血药物在发病初期的应用对疾病的治疗也具有决定性意义。