生产过程中或生产后的创伤
生产时或出生后五天内的小猫死亡大多与难产、食子癖或母性不良有关。食子癖大多数发生于神经质或高度敏感的母猫，不过，因为动物的天性，母猫会将生病的新生小猫吃掉，所以不能将所有的食子行为都认为是食子癖，这样的食子行为是为了保护其他健康的小猫，以免它们被疾病感染，并可以减少无谓的照料及母乳消耗。
母猫通常对于生病的新生小猫不会加以理睬和照料，甚至会将其叼出窝或推出笼外，这种行为很难与母性不良进行区分，需要具体情况具体分析。
体质太弱，体重过轻
新生小猫的出生体重理论上是不受小猫性别、同胎小猫数量以及母猫体重所影响的，在出生时体重过轻的小猫死亡率普遍也较高。早产是常见的引起出生体重过轻的原因，而大部分足月出生体重过轻的小猫都是因为先天性的异常或者营养原因产生的。
在六周龄内的小猫由于出生体重过轻会有较高夭折的可能性，并且可能引起某些小猫变成慢性发育不良，在幼猫期内死亡，所以小猫应该在出生时称重，并定期测量，直到小猫满六周龄。
小猫先天性的异常
新生小猫的先天异常大部分是由于基因问题所引起的，当然也会在像X光照射或某些药物作用等这些外在因素的影响下而产生畸形胎儿。
像中枢神经系统、心脏血管系统、呼吸系统的先天异常会让小猫立即死亡或在两周内死亡，而其他的先天性异常则可能直到小猫能完全自主行动后才会发现明显的影响，或者是在发现小猫的成长迟缓时才会被注意到，通常可以在注射预防针前的健康检查时被兽医发现。
一般所说的先天异常包括：腭裂、头骨缺陷、小肠或大肠发育不全、心脏畸形、肾脏畸形、下泌尿道畸形及肌肉骨骼畸形等。
畸形胎儿
有许多药物及化学物质被认为会导致胎儿畸形或夭折，因此在怀孕期间应避免使用任何药物及化学物质，特别是类固醇及灰霉素(治疗霉菌用的口服药)。
营养问题
给怀孕的母猫喂食了不适当的食物，可能会造成其生出虚弱或疾病的小猫。其中，特别是牛磺酸的缺乏会引起的问题有胎儿重吸收、流产、死产及小猫发育不良等。引起新生小猫营养不良的主要原因包括：母体严重营养不良、胎儿期缺乏适当的母体血液供应，以及胎盘空间的竞争。
新生儿溶血
新生儿溶血一般较少发生在田园猫身上，而在某些纯种的品种猫里会较常见。母猫的初乳中含有丰富的移行抗体，新生小猫的肠道只在24小时内可以吸收这些移行抗体，其中也包含某些同种抗体，A型血的猫咪仅具有微弱的抗B型同种抗体，而B型血的猫咪却拥有强大的抗A型同种抗体。
因此，如果B血型的母猫生出A或AB血型的小猫时，母猫的初乳中便含有大量的抗A型同种抗体，一旦新生小猫在24小时内吃了初乳后，这些抗A型的同种抗体便被吸收到了小猫的身体里，并与小猫的红血球结合而使之溶解，这种溶血的状态可能发生在血管内或血管外，从而引起严重的贫血、色蛋白尿性肾病、器官衰竭以及弥漫性血管内凝血，即使是初产的B型血母猫也会引发相同的问题。
母猫在怀胎期间，胎儿并不会与母体的同种抗体接触，所以，小猫刚出生还未吃初乳前大多是健康状态，可一旦吃了初乳之后便会在数小时或数日内出现症状，大部分的小猫会在第一天内便突然死亡而没有任何异状，或者，小猫会于最初三日内开始拒绝吃奶，并逐渐虚弱(临床的发现包括因严重血红素尿所引起的红褐色尿液，也可能发展成黄疸及严重贫血，并持续恶化而在一周龄内死亡。
幸运存活下来的小猫有少数会在第一周到第二周之间发生尾巴顶端的坏死)，或者小猫仍持续吃奶，并持续成长，除了尾巴顶端的坏死之外，无任何其他的明显症状发生。
传染病
传染病占了小猫夭折的大头，特别是断奶后期(5-12周龄)的细菌感染。这段期间内的死亡大多是因为呼吸道或胃肠道及膜腔的原发性感染，小猫在没有任何紧迫状况下与细菌接触时，通常表现不出明显的感染症状，或者症状轻微而自行痊愈。
但当环境或小猫本身具有不利因素时，一些疾病的感染就会变得较为严重，使得小猫的夭折率提高。当细菌感染超过小猫免疫系统所能抵御的程度时，便会形成新生儿败血症，影响的因素包括不适当的营养及温度控制、病毒感染、寄生虫及免疫系统的遗传或发育缺陷。通常引起败血症的细菌都是一些普通的常在菌。
多病毒性的传染病会引起新生小猫的夭折，包括：冠状病毒、细小病毒、疱疹病毒、卡里西病毒，及逆转绿酶病毒(传染性腹膜炎、猫瘟、猫支气管炎、猫流行性感冒、猫白血病)，临床症状依据传染的途径与时间，与初乳移行抗体的多寡而定，就算母猫有进行完整的预防注射，新生小猫也可能因为未及时吃到初乳而得不到足够的移行抗体保护。
其他因素
原虫及钩虫感染也可能引起小猫的夭折，过多的肠道寄生虫有害于小猫的生长，一般单纯的外寄生虫感染(跳蚤、壁虱等)很难引起小猫的死亡。有统计显示，第五次生产时的小猫存活率最高，第一次及第五次以后生产，小猫的存活率最低。中等体型的母猫生产的存活率也高于大型或小型的母猫，而胎儿只数为5只时有最低的夭折率。
在育种的过程中，小猫的折损几乎是无可避免的现象，正确的诊断及护理，可以减少这方面的损失。