仓鼠、大鼠、小鼠、沙鼠、天竺鼠和兔子是许多家庭中受欢迎的宠物。偶尔，这些动物可能携带病菌，或与野生动物接触，可能会感染疾病，然后传给它们的人类主人。
鼠咬热
鼠咬热是一种细菌性疾病。细菌由老鼠携带，是它们口鼻中正常菌群的一部分。人们可以通过被老鼠咬伤或抓伤而受到感染。高达10%的老鼠咬伤可能会导致老鼠咬伤热。其他动物，如老鼠、沙鼠、松鼠、猫和狗也会被感染，可能会也可能不会患上鼠咬热，并且会传播。鼠咬热在美国被认为是罕见的。作为工作的一部分处理老鼠的人或生活在老鼠出没地区的儿童患这种疾病的风险更高。
钩端螺旋体病
钩端螺旋体病是一种由称为钩端螺旋体的细菌引起的疾病，既感染人类，也感染各种动物。它发生在世界各地，但在世界的温带和热带地区更为常见。有些人感染了钩端螺旋体后根本没有任何症状，有些人则会病得很严重。一些野生和家养动物，如牛、猪、狗、浣熊和啮齿动物，携带钩端螺旋体细菌，并在其尿液中传递。被受感染的尿液污染的土壤或水是导致人类感染的最常见原因。
沙门氏菌病–啮齿动物和袖珍宠物
沙门氏菌病是由一组名为沙门氏菌的细菌引起的肠道细菌感染。这些细菌在受感染的动物和人类的粪便中脱落。当一个人吃了被沙门氏菌污染的食物或喝了水或牛奶，就会发生感染。感染沙门氏菌可引起严重的疾病，特别是在5岁以下的儿童、老年人和免疫系统较弱的人。
淋巴细胞性脉络膜炎（LCMV）
淋巴细胞性脉络膜炎（LCMV）的主要宿主是普通家鼠。宠物啮齿动物在与宠物店或家庭中的野生家鼠接触后可能会被感染。孕妇感染LCMV的风险最大，这可能导致未出生婴儿的出生缺陷和智力障碍。
猴痘
猴痘是一种由病毒引起的疾病。尽管被命名为 “猴痘”，但该疾病的来源仍然不明。然而，非洲的啮齿动物和猴子可能有这种病毒并感染人。在非洲，感染猴痘的人中有一到百分之十会死亡。2003年，感染猴痘的非洲啮齿动物被带入美国，并与草原犬一起饲养，这些草原犬被感染后作为宠物分布在几个州。超过70人被确认为在与草原犬或其环境接触后患上了猴痘。如果人们被受感染的动物咬伤，或者接触到动物的体液或血液，就会从受感染的动物那里得到猴痘，受感染的人可以通过打喷嚏或咳嗽产生的呼吸道飞沫将该疾病传播给其他人。2022年开始爆发的猴痘已经蔓延到许多通常不报告猴痘的国家，包括美国。在这次爆发中，猴痘正在通过密切的身体接触进行传播。目前还没有专门针对猴痘病毒感染的治疗方法。然而，由于猴痘和天花病毒相似，某些为防止天花而开发的抗病毒药物和疫苗可用于预防和治疗猴痘病毒感染。